內毒素為細菌外膜的特征性組成成分，對于細菌外膜的結構與功能起著十分重要的作用，這里我們僅簡述一下內毒素與磷脂分子在結構上的差別。

（1）內毒素的類脂A部分在D-氨基葡萄糖骨架上聯結6~7個脂肪酰殘基，而一般的磷脂僅聯結有兩個脂肪酸。

（2）一般的磷脂其脂酰基可為飽和或不飽和脂肪酸，而類脂A含飽和或3-羥基脂肪酸，后者中的羥基可被飽和脂肪酸進一步酰化而形成3-脂酰基脂肪酸，這是內毒素（類脂A）的*成分。

（3）內毒素在類脂A分子上的磷酸基團及核心中的KDO成分可攜帶多量的負電荷，因而內毒素與陽離子可發生強烈的相互作用。因此陽離子的存在對于內毒素的物理特性及生物學功能可發揮顯著的影響。

（4）許多革蘭氏陰性菌突變株可產生不完-全的內毒素結構，如rfb突變產生Ra型內毒素，這種內毒素僅含有完整的核心及類脂A分子，但缺失O-特異多糖鏈；rfaC突變株則產生Re型內毒素，這種內毒素分子僅含有類脂A及2~3個分子的KDO，大部分的核心成分及O-特異性多糖側鏈均缺失。