O抗原多聚體一旦與脂質A核心連接，就停止多聚化反應。也就是通常所說的連接反應能夠終止多聚化反應。脂質A核心及已結合不同長度重復單位的脂多糖都能有效地轉移到外膜上，因此用SDS-PAGE能看到脂多糖分子大小不一，這是由于生物合成系統的差異而不是輸出系統的因素所致。

不同細菌的O抗原側鏈分布不同，有的含約20個重復單位的多聚體占據優勢，有的可能為約100個重復單位的多聚體占據優勢，在SDS-PAGE電泳中由于不同種屬的細菌其不同分子的銀染色著色強度差異得到體現。不同細菌的O抗原側鏈長度分布不同的原因，可能在O抗原的多聚化或連接反應過程中有一個大小選擇因子在起作用。在以Wzy依賴型途徑合成抗原的細菌中，Wzz（即Rol或Cld）是調節側鏈長度分布的重要蛋白質，但其具體作用機制目前還不清楚。